首先是費用問題, 由於無痛人流手術需要使用麻醉劑, 還需要配備專門的麻醉師, 所以費用比普通人工流產要高。
另外, 無痛人流是借助於靜脈麻醉, 而任何一種麻醉手術都會有風險, 目前各種麻醉劑雖然基本符合要求, 但還沒有一種能達到最理想的麻醉劑, 種種原因仍可能導致呼吸抑制、迴圈抑制、藥物過敏等不良反應。 儘管它的危險發生概率極小, 但在術前醫師還是必須與受術者和家屬進行告知。
再有, 全身麻醉後, 子宮質地變軟, 醫生操作時手感有別于正常狀態, 而患者處於神志不清,
任何人流方式都會危害身心!事實上, 人流只能是避孕失敗後一種補救的辦法, 不能替代常規避孕方法。 只要是流產, 包括藥物流產, 都會對身體造成損害。 如果在短期內反復流產, 更會影響子宮創面的修復而造成子宮腔粘連、月經量減少等不良後果。 此外, 多次人工流產還可能導致前置胎盤、產後胎盤粘連, 甚至產後大出血。 如發生感染, 則會引起盆腔炎、輸卵管炎, 甚至引起不孕。