目前， 臨床上關於系統性紅斑狼瘡的治療藥物及方法主要包括以下內容：
1、非甾體類抗炎藥
主要包括雙氯芬酸、洛索洛芬等， 正確的使用此類藥物可以緩解發熱、關節疼痛等症狀， 同時可減少激素的用量及相關副作用。
2、抗瘧藥
包括氯喹、羥氯喹等， 是治療系統性紅斑狼瘡較為常見的藥物之一， 具有抗炎、免疫抑制等作用。
3、糖皮質激素
糖皮質激素如強的松龍等， 是治療系統性紅斑狼瘡的基礎用藥， 具有強大的抗炎和免疫抑制作用， 可緩解急性期的症狀， 逆轉病情。
4、免疫抑制劑
包括甲氨蝶呤、環磷醯胺、硫唑嘌呤等等，
5、免疫淨化法
包括血漿置換及免疫吸附等方法， 此法可以迅速有效的去除致病成分， 對快速緩解病情進展， 提高藥物療效起到很好的作用。
6、幹細胞移植
幹細胞是一類具有自我更新和分化潛能的細胞， 最新研究發現， 成體幹細胞可以橫向分化為其他類型的細胞和組織。 目前， 此法治療系統性紅斑狼瘡尚在臨床上試用。
除此之外，
還包括抗凝療法如應用小劑量的阿司匹林；丹那唑等性激素治療以及植物藥如雷公藤多甙、白芍總苷的應用等等。
