1.選擇手術方式：腎輸尿管癌行腎輸尿管切除包括膀胱壁段已有50年歷史， 如不做輸尿管全長切除則輸尿管發生腫瘤的可能性高達84%。
近年的認識隨著對腫瘤的生物學的特徵的瞭解， 腎輸尿管腫瘤手術不能千篇一律。 低期低級的腎輸尿管癌行部分腎輸尿管切除和根治手術療效相同。 高期高級癌則應行根治性手術， 否則難以治癒， 特別是細胞學陽性者。
有主張高期高級的局限的癌病變時仍可行部分切除的手術， 最後發現90%死於癌， 而根治手術者死於癌僅30%。 輸尿管切除必須包括膀胱壁段， 否則60%可發生膀胱癌。
孤立腎或雙腎同時有腫瘤者如屬低期低級， 尿細胞學陰性者應爭取盡可能保留腎組織， 高期高級者則透析下根治手術。 有時對細胞學陰性低級的腫瘤行徑腎盂鏡檢切除腫瘤。 輸尿管腫瘤行部分切除保留腎臟者約占20%。
已如前述腎盂輸尿管腫瘤容易出現器官腫瘤， 必須緊密隨訪有主張每6個月行尿細胞學檢查一次， 膀胱鏡檢查隨訪2年。
在治療腎輸尿管腫瘤時必須注意與輸尿管息肉相鑒別， 輸尿管息肉是間葉組織上覆的一層薄的良性尿路上皮， 蒂很長， 且可以有分支表現光滑， 細胞學陽性。 組織內混有血管和纖維組織，
2.治癒標準
⑴手術切除後， 切口癒合。
⑵良性腫瘤(息肉)行單純腫瘤切除， 輸尿管無梗阻。
3.好轉標準
⑴切除範圍不夠， 留有轉移灶。 或原發灶未能切除， 行尿流改道術。
⑵良性腫瘤切除術後， 輸尿管梗阻未完全解除。
