甲亢患者的藥物治療常需要較長療程， 在用藥上常存在一些誤區， 如用藥一成不變、藥量偏小、時斷時續、療程不足、多多益善等， 如果不能及時糾正這些誤區， 可能導致藥物治療效果不佳。
常用的口服抗甲狀腺藥物一般分為治療階段、減量階段和維持階段， 每個治療階段使用的藥物劑量和時間長短都不一樣。 如果一成不變地一直按照治療劑量用藥， 容易導致服藥過量， 造成藥物性甲減。
部分甲亢患者認為抗甲狀腺藥物有一定毒副作用， 小劑量服藥相對比較安全， 因此盲目減量。 其實這種做法可能會導致治療無效而延誤病情，
藥物發揮療效主要依靠其在血液中的有效血藥濃度， 如果時斷時續地服藥可能導致血藥濃度波動， 不能維持有效濃度， 因而導致療效不穩定。
甲亢患者藥物治療需要一定的時間， 一般需要一、兩年， 如果病情反復者， 服藥時間還需延長。 有些甲亢患者通過服藥治療後症狀消失， 或是檢查甲狀腺功能正常就自行停藥， 導致療效不足， 病情復發， 加大治療難度。
治療甲亢的中藥和西藥都有一定的適應證， 誤以為藥物越多療效越好、療程越短， 可能導致治療藥物配合不當， 引起毒副作用。
