尤其是一些慢性肝炎患者， 當他們通過驗血、做日超都無法明確診斷或確定其療效時， 都可以通過這項檢查來瞭解其肝病的進展情況。 但是由於“肝穿”在技術方面的要求高， 同時也具有一定的危險性， 再加上不少基層醫務人員對“肝穿”在肝病診斷上的意義並不清楚， 因此大部分肝病患者都拒絕接受這項檢查， 致使這項檢查手段至今難以普及。
進行“肝穿”之所以具有一定的危險性， 是因為肝臟的血流豐富， 進行肝穿刺時可能會發生出血。 但臨床實踐證明， 進行“肝穿”時出血的發生率僅在萬分之一左右。
1、當乙肝患者的e抗原呈陽性、乙肝病毒DNA呈陽性、肝功能正常， 且無明顯的臨床症狀， 其該不該接受治療無法確定時。 臨床實踐證實。 這一結論取決於該患者肝臟組織的炎症程度和肝纖維化的程度。
2、當一些在抗病毒治療中取得明顯療效的患者經過一段時間的鞏固治療後難以確定其是否應停止用藥治療時， 可以通過為其做肝活組織的病理學檢查來明確。 有些乙肝患者最擔心的就是其所進行的抗病毒治療是不是要延續終生。 接受了正規的治療後， 經化驗檢查其乙肝病毒的複製指標已轉陰、其乙肝病毒e抗原已轉換為乙肝病毒e抗體、其肝功能已持續正常時， 就可以通過“肝穿”進行免疫組化檢查， 瞭解其肝組織內乙肝病毒核心抗原的情況。 如果上述檢查結果顯示其乙肝病毒核心抗原為陰性， 這就說明該患者的肝病已經基本治癒， 就可以暫停進行抗病毒治療， 以後只需密切隨訪觀察其病情的變化就可以了。
3、對於病因不明確、血清轉氨酶持續升高且出現黃疸的病人， 可以通過“肝穿”進行肝活組織的病理學檢查， 以明確其肝臟的損害情況。
總之， 對於在診斷和治療中有困難的肝病患者， 可以通過“肝穿”為其做肝活組織的病理學檢查。 這種檢查方法不僅可以直接瞭解患者肝組織帥損害情況， 而且也有利於患者針對其肝組織的損害情況進行準確的治療。
肝穿刺活檢的價值有以下八點：
1.有利於多種肝病的鑒別診斷
許多臨床診斷比較困難的慢性肝病， 如各型病毒性肝炎、酒精性肝炎、肝結核、肝肉芽腫、血吸蟲病、肝腫瘤、脂肪肝、肝膿腫、原發性膽汁性肝硬變及各種代謝性肝病（肝豆狀核變性、肝糖原累積病、肝臟澱粉樣變性）等，
2.瞭解肝臟病變的程度和活動性
肝穿刺活組織檢查是一種能直接瞭解肝組織的病理變化， 並可以做出較客觀、精確診斷的檢查方法。 有不少慢性乙型肝炎患者， 感染肝病病毒時間很長， 但抽血化驗發現轉氨酶異常可能僅有半年時間， 肝病病毒含量水準也不高。 這樣的病人通過肝穿刺能發現慢性肝病是否處於活動期， 並能推斷其病變的輕重程度。
3.提供各型病毒性肝炎的病原學診斷
依據大部分肝炎病毒是嗜肝病毒，
它們往往多在肝組織中寄生。
只有血清肝病病毒達到一定量時，
臨床化驗才能夠檢測得到。
所以目前仍有一些病毒性肝炎，臨床化驗顯示血清肝病病毒標誌物全部是陰性，難以確定其病原。但是，通過肝穿刺，用超敏感免疫組織化學和原位分子雜交技術，可檢測出寄生在肝組織中的肝炎病毒。
4.發現早期、靜止或尚在代償期的肝硬化肝硬化
特別是肝纖維化，在發病早期，通過血液化驗、B超檢查一般難以發現。但是通過肝臟穿刺檢查，可以對肝臟纖維化和早期、靜止或尚在代償期的肝硬化進行精確診斷，並能夠鑒別肝硬化臨床類型，區分是酒精性肝硬化，還是肝炎後肝硬化，以及是否伴有活動性肝炎。例如，一些診斷為慢性無症狀肝病病毒攜帶者的患者，通過肝臟穿刺檢查，可發現是活動性肝硬化或慢性活動性肝炎。
5.有利於藥物的選擇和藥物的療效判斷
治療前後肝活檢組織病理變化是評判藥物治療效果的可靠指標，為臨床藥物治療提供客觀的評價依據。目前常用的抗肝病病毒的藥物有干擾素與拉米夫定，應用干擾素或拉米夫定進行抗病毒治療，不僅療程長，且價格昂貴。治療前如能進行肝穿刺，根據肝組織炎症活動程度，有選擇性和針對性地應用抗病毒藥物，將明顯提高療效。
6.鑒別黃疸的性質和原因
臨床上黃疸往往難以確定病因，可做肝活檢。它可以確定黃疸是膽紅素代謝障礙，或是肝細胞性黃疸，還是膽汁淤積所致，是病毒性還是藥物引起。不同的病因，預後和治療是完全不同的，只有診斷清楚，才能制定正確的診療方案。
7.作為慢性肝炎病情、預後的評判指標
肝穿刺可發現肝組織的病變情況，為病情變化、預後的判斷提供客觀依據。重型肝炎如以肝細胞水腫為主，則病情較輕，預後較好，病死率較低；如以肝細胞壞死為主，且正常肝細胞殘存率較低，則病情嚴重，預後較差，病死率高。
8.可以進行診斷性治療
在B超或CT引導下，有目的性地肝穿刺，可開展肝膿腫穿刺排膿、注射藥物，無水酒精瘤內注射治療肝癌等。在進行穿刺取材、診斷的同時，還可以開展診斷性治療，做到診斷治療兩不誤。
肝穿刺後出血的發生率在十萬分之一左右，由於肝活檢技術已經很成熟，只要掌握好適應症、禁忌症，在肝穿刺前做好充分的準備，肝穿刺活檢的操作可做到萬無一失。
所以目前仍有一些病毒性肝炎，臨床化驗顯示血清肝病病毒標誌物全部是陰性，難以確定其病原。但是，通過肝穿刺，用超敏感免疫組織化學和原位分子雜交技術，可檢測出寄生在肝組織中的肝炎病毒。
4.發現早期、靜止或尚在代償期的肝硬化肝硬化
特別是肝纖維化，在發病早期，通過血液化驗、B超檢查一般難以發現。但是通過肝臟穿刺檢查，可以對肝臟纖維化和早期、靜止或尚在代償期的肝硬化進行精確診斷，並能夠鑒別肝硬化臨床類型，區分是酒精性肝硬化，還是肝炎後肝硬化，以及是否伴有活動性肝炎。例如，一些診斷為慢性無症狀肝病病毒攜帶者的患者，通過肝臟穿刺檢查，可發現是活動性肝硬化或慢性活動性肝炎。
5.有利於藥物的選擇和藥物的療效判斷
治療前後肝活檢組織病理變化是評判藥物治療效果的可靠指標，為臨床藥物治療提供客觀的評價依據。目前常用的抗肝病病毒的藥物有干擾素與拉米夫定，應用干擾素或拉米夫定進行抗病毒治療，不僅療程長，且價格昂貴。治療前如能進行肝穿刺，根據肝組織炎症活動程度，有選擇性和針對性地應用抗病毒藥物，將明顯提高療效。
6.鑒別黃疸的性質和原因
臨床上黃疸往往難以確定病因，可做肝活檢。它可以確定黃疸是膽紅素代謝障礙，或是肝細胞性黃疸，還是膽汁淤積所致，是病毒性還是藥物引起。不同的病因，預後和治療是完全不同的，只有診斷清楚，才能制定正確的診療方案。
7.作為慢性肝炎病情、預後的評判指標
肝穿刺可發現肝組織的病變情況，為病情變化、預後的判斷提供客觀依據。重型肝炎如以肝細胞水腫為主，則病情較輕，預後較好，病死率較低；如以肝細胞壞死為主，且正常肝細胞殘存率較低，則病情嚴重，預後較差，病死率高。
8.可以進行診斷性治療
在B超或CT引導下，有目的性地肝穿刺，可開展肝膿腫穿刺排膿、注射藥物，無水酒精瘤內注射治療肝癌等。在進行穿刺取材、診斷的同時，還可以開展診斷性治療，做到診斷治療兩不誤。
肝穿刺後出血的發生率在十萬分之一左右，由於肝活檢技術已經很成熟，只要掌握好適應症、禁忌症，在肝穿刺前做好充分的準備，肝穿刺活檢的操作可做到萬無一失。
