儘管結腸癌腹腔鏡手術與開腹手術相比較， 具有術野清晰， 出血少， 創傷小、疼痛輕等優點， 但並不是所有的患者都適合這種手術的方式。
1、耐受長時間氣腹的疾病（如嚴重的心肺疾患及感染）
腹腔鏡結腸手術往往游離範圍廣， 常需在手術過程中多次變換體位， 方能完成切除腸段的游離。 體位過度地調整， 加上持續的氣腹壓力， 使腔靜脈回流阻力增加、膈肌上抬、心肺活動受限， 導致血流動力學改變。
2、導致難以控制出血的情況（如門靜脈高壓症、凝血功能障礙等）
凝血功能障礙無論對開腹還是腹腔鏡手術都可能導致術中難以控制的出血。 腹腔鏡手術對出血尤為敏感， 極少的出血都可使視野亮度降低、解剖層次不清、術野模糊。 所以， 對於常見凝血功能障礙， 如門靜脈高壓症等要及時治療， 盡可能於術前予以糾正， 降低手術風險。
3、技術受限的情況（病理性肥胖、腹內廣泛粘連、合併腸梗阻和妊娠等）
不少腹腔鏡技術受限的禁忌證是相對概念， 病理性肥胖很難有確切的界定， 將肥胖納入禁忌是因為肥胖患者腹腔鏡手術空間顯露受限， 解剖層次不清， 一些重要結構標誌的辨認困難， 操作者的技能及專業分析綜合能力要求高。
4、腫瘤侵及鄰近組織和器官如輸尿管、膀胱和小腸等
晚期腫瘤已侵及臨近器官， 如輸尿管、膀胱、小腸、十二指腸等手術已失去根治意義。 然而， 仍應力爭姑息性切除癌腫， 以減少癌瘤對機體的消耗， 防止出血和梗阻。 手術因涉及鄰近器官的切除甚至重建， 所以難度很大， 一般不主張在腔鏡下實施。
