新鮮肛裂：經非手術治療可達癒合， 如局部熱水坐浴， 便後用1：5000高錳酸鉀溶液坐浴， 可促使肛門括約肌鬆弛；潰瘍面塗抹消炎止痛軟膏（含地卡因、黃連素、滅滴靈等）， 促使潰瘍癒合；口服緩瀉劑， 使大便鬆軟、潤滑；疼痛劇烈者可用普魯卡因局部封閉或保留灌腸， 使括約肌鬆弛。
陳舊性肛裂：經上述治療無效， 可採用手術切除、包括潰瘍連同皮贅（前哨痔）一併切除， 還可切斷部分外括約肌纖維， 可減少術後括約肌痙攣， 有利癒合， 創面不予縫合， 術後保持排便通暢， 熱水坐浴和傷口換藥， 直至完全癒合。 近年來採用液氮冷凍肛裂切除術，
【中醫治療】
中醫對肛裂的治療， 不僅在手術技術方面有許多獨創， 而且在藥物治療方面有非常豐富的醫療經驗。
(1)燥火便結：一般症見大便堅硬燥結， 排糞時肛門劇烈疼痛， 便後略有緩解， 爾後可持續疼痛數小時， 甚則整日疼痛不減， 便時鮮血隨之而下， 多呈點滴狀。 常因大便燥結痛苦， 而不敢正常進食， 伴有心煩意亂， 口苦咽幹， 舌苔黃燥， 脈數。
證屬：燥火鬱結， 結於腸道。
治法：宜清熱瀉火， 潤腸通便。
方用：梔子金花丸， 或以此方加減使用。 外用祛毒湯熏洗， 敷生肌玉紅膏於傷口。
(2)濕熱蘊結：便時腹痛不適， 排便不爽， 肛門墜脹， 時有粘液鮮血， 或可帶有膿血，
證屬：濕熱下注， 蘊結於肛。
治法：清化濕熱， 潤腸通便。
方用：黃連東加減內服。
外用四黃膏敷肛裂處。 或回肛散
(3)血虛腸燥：便時肛門疼痛， 流血， 大便秘結， 皮膚乾澀， 口乾舌燥， 心煩失眠， 午後潮熱， 舌紅少苔， 脈細數。
證屬：血虛腸燥， 結而化火。
治法：涼血養血， 潤燥通便。
方用：麻仁潤腸丸， 或用濟川煎即可。
