藏醫艾灸療法歷史悠久， 運用廣泛， 主要用來治療一些寒性病， 如消化不良、胃火衰敗、浮腫、水腫、黃水症、瘰鬁、炭疽、神經錯亂、健忘症、脈病等， 其中黃水病和脈病療效尤佳。 在熱病的後期， 也可運用火灸施治。
艾灸通過封閉脈道要隘， 使病邪不致流竄於脈道， 從而起到鎮痛， 治消化不良， 化痞塊， 幹黃水的作用， 使胃火增生， 神志清明。 艾灸的製作是一個很精細的過程。 一般在秋天擇吉日採集艾葉， 用棍打碎， 再揉成艾絨團。 艾絨團的大小看所灸的部位不同而有差別：用於關節者， 大小如姆指；用於頭部和四肢者，
艾灸取穴， 一般有固定的穴位， 一種是依據病人自訴症狀部位定穴。 患病的穴位按之疼痛且舒適， 痛點即施灸的穴位， 這與漢語中醫的阿是穴頗為相似。 另一種是分佈在全身各個部位的固定穴， 醫生根據臟腑經絡選穴。
藏醫常用的灸法有以下四種：
1．煮法：適用於慢性的頑症， 如瘰鬁、痞塊、癰癤等。
2．燒法：適用于心風病、黃水病等。
3．烤法：適用於隆病、蟲症、大小便秘閉不通者。
4．擬法：所用艾柱較小， 多用於兒童， 驚痛時即可移去。
