在數以萬計的接種對象中， 疫苗接種後的反應大多數是輕微的。 由於使用的疫苗主要是蛋白性抗原物質， 其中使人體產生反應的物質很難完全去除， 或者免疫原性物質本身就是一種反應原， 加上人群的個體差異較大， 不同疫苗引起的反應強度和表現並不完全一樣， 有輕有重。 通常可分為一般反應、加重反應和異常反應。
一般在接種後局部可發生紅、腫、熱、痛等， 多數反應輕微， 局限在一定限度內。 有時可出現一些全身反應如發燒、頭疼、頭暈、噁心、嘔吐、腹痛等， 均為一般性的。 這些反應不會造成組織器官不可恢復的損傷和功能障礙，
當被接種者由於某些生理或病理原因如過度勞累、經期、劇烈運動、飲酒等， 或疫苗使用不當， 或某些批號疫苗的品質原因， 以致上述反應強度加重或發生反應的人數超過正常比例， 則可稱為加重反應。 加重反應仍屬於正常反應。
異常反應和上述一般反應同時或先後發生， 但只是個別人或少數人發生， 發生的多少與疫苗種類和接種者體質有密切關係。 異常反應通常有以下幾類：非特異性的無菌性化膿；精神性反應如暈針、癔病和急性休克性精神反應， 這一類反應與精神因素和身體素質有關；常見的變態反應有過敏性皮疹、過敏性紫癜、血管神經性水腫及較嚴重的過敏性休克。
接種疫苗後還可能偶合其他疾病， 一種情況是， 被接種者正處於某一急性傳染病的潛伏期， 接種後剛好發病；另一種可能是被接種者已患有某種疾病， 但臨床症狀不明顯， 接種以後， 症狀表現明顯或加重；還有些慢性病人在接種後發生症狀加重或急性發作的情況。 這一些情況統稱為偶合或誘發。 偶合及誘發其他疾病是一種巧合， 但有些人把這種情況與接種反應混為一談， 這是不對的。
