無症狀扁平苔蘚不需治療。 如懷疑為藥物或化學物引起應立即停用, 抗組胺藥物(如口服羥嗪25mg或撲爾敏4mg, 每日4次)或許是通過其鎮靜作用來減輕中度瘙癢。 限局性瘙癢性或肥大性損害可用醋酸去炎松混懸劑以鹽水稀釋2.5~5mg/ml注入皮損淺層, 使損害稍隆起即可(至少間隔3周以上方可再注射)。 亦可用皮質類固醇激素封包療法(即用0.1%醋酸去炎松霜或更強的局部皮質類固醇激素於睡前用聚乙烯封包, 或者用丙酮縮氟氫羥龍膠布敷貼)。 0.1%維甲酸溶液配合皮質類固醇激素治療光滑皮膚扁平苔蘚亦有效,
糜爛性口腔損害和廣泛性, 嚴重性瘙癢皮損常需用全身皮質類固醇激素治療(開始時口服強的松每晨40~60mg, 每週約遞減1/3量)。 然而, 停藥後瘙癢又會復發, 可試用小劑量皮質類固醇激素隔日晨服, 如病人仍有瘙癢, 可應用PU-VA治療。
其他可以用於治療嚴重病例獲得成功的全身療法包括維甲酸:依曲替酯和異維甲酸, 環孢菌素, 環磷醯胺以及PUVA等。 口腔糜爛扁平苔蘚可以口服氨苯碸或環孢菌素含漱。 本病傾向於自限性, 但數年後又可復發。