許多藥物可以自由地通過胎盤， 有些藥物可能會引起胎兒的發育異常， 甚至造成胎兒畸形， 所以， 原則上最好不用藥， 但如有用藥的必要， 則應注意以下九項原則：
一是懷孕就診要注意月經期。 應告訴醫生自己已懷孕和妊娠時間;有受孕可能時， 用藥需注意月經是否過期。
二是不能自行用藥。 孕媽媽的疾病同樣會影響胎兒， 因此既不能濫用藥物， 也不能有病不用。 不能自選自用藥物， 一定要在醫生的指導下使用已證明對胚胎與胎兒無害的藥物。
三是可用可不用的藥物應儘量不用或少用。 尤其是在妊娠的頭3個月，
四是用藥必須注意孕周， 嚴格掌握劑量、持續時間。
五是堅持合理用藥， 病情控制後及時停藥。
六是兩種以上的藥物有相同或相似的療效時， 考慮選用對胎兒危害較小的藥物。 有A、B類藥可用， 則應選用A類藥。 在無A、B類藥可以選時慎用C類藥。 D類藥只有無其他藥可選且孕媽媽病重急需用藥時才選用。 對於未經動物實驗及臨床資料報導證實有無危害的藥物儘量不用。 因為無資料證實不等於無危險。
七是肯定的致畸藥物禁用。
八是能單獨用藥就避免聯合用藥， 能用結論比較肯定的藥物就不用比較新的藥。
九是孕期禁用試驗性用藥， 包括妊娠試驗用藥。
