一、局部藥物治療
（1）5%足葉草毒素酊外用， 每日2次， 連用3d， 停藥4d， 為1療程， 可用1-3個療程。 每日用藥總量不應超過0.5mL。 療效好， 但對周圍皮膚黏膜刺激大， 要注意保護。 有致畸作用故孕婦禁用。
（2）10%-25%足葉草酯酊外用， 每週1次， 塗藥2-4h後洗去。
（3）50%三氯醋酸溶液外用， 每週1次， 利用其化學性剝脫作用去除疣體。 最多連用6次。 注意保護周圍皮膚黏膜。
（4）5%咪喹莫特霜是一種局部免疫增強劑， 通過誘導局部產生干擾素及其他細胞因數發揮間接抗病毒作用。 外用， 每週3次， 用藥8-10h後洗掉。 連用8-16周。
（5）5%氟尿嘧啶霜屬於細胞毒類藥物，
（6）3%肽丁胺霜有一定治療作用， 外用， 每日2次。
二、局部物理治療和手術治療
物理治療包括鐳射、高頻電、微波及液氮冷凍等方法。 手術治療適用於有蒂或體積大的疣體的治療， 包皮過長患者可施行包皮環切術一併把疣體切除。
三、全身藥物治療
無有效的單純抗病毒藥物， 主要用免疫療法， 調節機體免疫力， 以達到減少或阻止疾病的復發。
（1）干擾素具有抗病毒、免疫調節的作用。 肌內、皮下或皮損基底部注射， 每週3次， 連用1-3個月。
（2）轉移因數皮下注射， 每次3U， 每週3次， 連用2-4周。
（3）HPV疫苗三期臨床試驗表明具有一定療效， 前景有待於進一步證實。
