1、內口底一定要徹底切除， 包括肛瓣、肛竇、肛腺、部分內括約肌， 及內口潰瘍與周圍瘢痕組織全部切除。 因為內口處理的好壞， 是關係到肛瘺能否徹底治癒的重要環節！
2、內口切除後， 還要向上適當延長切口0.5--1.0釐米， 深度與瘺道適應為宜。
3、內口如果在母痔區的話， 在切除內口的時候應該結紮內痔， 這樣可以預防術後大出血， 切記。
4、瘺道內注入美藍等色素後， 應注意肛瘺是否只有一個內口， 或與臨近的幾個肛竇相通。
手術時凡有漏色的肛竇， 應一慨全部切除， 但也要注意色素液不宜注入太多，
還有一類病人， 專家會採用另一個方法， 但願會給大家有所幫助！
因為有一部份肛瘺病人不是急性或者亞急性期的時候來就診， 也就是說他來看病的時候瘺管是完全封閉的， 專家會在肛瘺外口處找到瘺管， 順瘺管將瘺管組織完全剔除， 當然包括內口一起剔除， 再擴大創口引流， 此方法適用於外口距肛緣5釐米以內的患者。 如果比較遠的或者是複雜性肛瘺可以在你確定瘺管的位置下（複雜性肛瘺先打到主幹瘺管）另開一個口， 按上述方法剔除就行， 而遠端搔刮引流。
補充三點：
（1）瘺管碘油造影的準確性很差， 平面片不直觀， 加之碘過敏等原因， 目前漸趨淘汰。 MRI和腔內B超是發現肛瘺走向、位置、內口所在的很好方法，
（2）手術前或手術時的肛門鏡檢查也很重要。 通常內口部肛竇凹陷加深， 充血， 或有分泌物流出。 結合指診、探針檢查的話意義更大。
（3）內口未必都是貫通的， 封閉者較多。 多種方法互參確認內口， 可提高準確性。
商討兩點：
（1）專家認為肛瘺沒有必要待瘺管全部形成後再作根治手術， 可以在急性膿腫期或切開排膿後任何時間進行， 前提是內口明確並且有把握處理好。 術後併發症的出現主要與技術和對治療原則的把握有關， 與瘺管壁是否形成無關。
（2）“內口切除後， 還要向上適當延長切口0.5--1.0釐米， 深度與瘺道適應為宜。 ”其實沒有必須延長這麼多， 那樣做損傷大且容易出血。 通常採用的是結紮內口處兩邊緣粘膜（連同兩側的肛竇）的方法。
