薏苡仁是治病之良藥， 具有除風濕、止痹痛、利關節、緩拘攣、健脾去濕、止帶止瀉之功。
薏苡仁治療濕滯絡脈肌膚之痹痛， 如《本經》記載“苡仁主筋急拘攣， 不可屈伸， 久風濕痹”。 《金匱要略》用薏苡仁配麻黃、杏仁、甘草組成麻杏苡甘湯用於患 “風濕一身盡痛”者。 薏苡仁常用於胸痹止痛， 《金匱要略》雲：“胸痹緩急者， 薏苡附子散主之。 ”即以薏苡仁配附子， 助陽化濕， 緩急止痛；用於寒濕胸痹， 也常與薤白、蒼術、乾薑、檀香、木香等配伍。
薏苡仁善去濕而有清熱解毒排膿之功， 治療肺癰可單用， 如《濟生方》即單用薏苡仁治療肺癰的記載；千金葦莖湯中用薏苡仁、冬瓜仁、桃仁治肺癰成膿確有療效。
薏苡仁為健脾去濕之良藥， 婦人脾虛帶下最為常用， 常與黨參、焦白術、山藥、扁豆等配伍應用。 薏苡仁健脾也善治脾虛泄瀉， 如治療脾虛泄瀉的良方參苓白術散， 即是由薏苡仁配伍人參、茯苓、白術、陳皮、桔梗、扁豆等組成。
《別錄》謂薏苡仁“利腸胃， 消水腫， 令人能食”。 近代醫家也常用薏苡仁作為利尿消腫之要藥。 如白菜苡仁湯可用生薏苡仁30~50克， 白菜500克， 共煎湯食之， 具有健脾去濕， 清熱利尿作用，
薏苡仁也是食補療法的要物， 含有蛋白質、澱粉、維生素等， 營養豐富， 效用廣泛。 《本草綱目》載有藥糕治病， 用薏苡仁與米粉、麥粉或豆粉做成糕食用， 功能健脾養胃， 益氣和中， 主治脾胃虛弱， 症見食少腹脹， 納呆， 面黃肌瘦， 便溏泄瀉者， 可作點心常服。 《聖濟總錄》記載用薏苡仁餅主治虛勞證；《醫學衷中參西錄》取生薏苡仁、生山藥配製成“珠玉二寶粥”， 對老年病、久病、胃氣不足者均適用。 筆者在臨床也常用薏苡仁、大米、小米、紅棗煮粥食之， 確有健脾和胃， 促進康復之效果。
