從中西醫的區別來看， 中醫治人， 西醫治病；中醫進行系統的機理調節， 而西醫是器官修理；中醫先經驗、再臨床、而後研究， 西醫則是先有理論基礎、再臨床、而後發展藥物；中醫更宏觀， 西醫更微觀；中醫是多維、集成思維， 而西醫是點式、線性思維；中醫遵循個性差異原則， 西醫則是普適性；中藥常為複方， 西藥則注重有效成分；中醫是通過內部調節， 西醫則是進行外部干涉；中醫講循序漸進， 西醫追求快速反應；中醫在人身上實踐後， 運用到更多人， 西醫則是在動物實驗基礎上再給人使用。
中西醫應該相互學習和借鑒，
因此， 對中醫藥的創新研究方法， 一是傳承精髓不動搖， 去粗取精不保守。 在創新路徑方面， 要通過思維跨越， 創新方式， 突破關鍵技術， 改革工藝， 從而發明革新。 二是高位嫁接， 引進、消化、吸收、再創新。 中醫藥要與其他學科交叉融合， 引進系統論和控制論、生物工程、資訊化、分子生物學、現代診斷方法， 融合現代人才和技術， 達到創新方法的目的。 三是開發特色中醫藥產品。 包括對經典方劑保護和二次開發， 研發以中醫理論為基礎的醫療器械， 開展未病、老年、特殊群體、休閒保健等方面的健康服務。 四是建設中醫藥文化。
我認為， 中醫藥方法學的進步必將帶來重大突破。
