病有感於外者， 有因於內者， 即有外感和內傷之分。 儘管中醫對病因認識的主體思維是“審證求因”， 儘管臨證多有外感合內傷者， 儘管臨證每有不易分辨外感與內傷者， 但明辨外感與內傷， 對臨證者而言， 仍然是非常重要的， 因為這種分辨直接影響到治療。
對於外感病， 醫者治療的著眼點主要在於邪氣， 給邪以出路， 使邪去而正安， 這是治療的終點。 基於此， 辨證模式多選用帶有“層次”、“通道”等思辯痕跡的辨證法， 如六經辨證、衛氣營血辨證、三焦辨證等。
對於內傷病， 醫者治療的著眼點主要在於正氣， 恢復正氣的正常循行布化，
經方可以治療外感病， 也可以治療內傷病， 這是毋庸置疑的。 關鍵是， 同一首經方， 在治療外感病和治療內傷病時， 其用法往往有別， 這一點需臨證者推敲、體會。
小柴胡湯用於外感病， 主要作用在於和解表裡， 祛邪外出。 小柴胡湯用於內傷病， 每每用其疏調肝脾、疏解鬱熱等。
明代醫家薛立齋在《內科摘要》中載一案：“太守朱陽山因怒腹痛作瀉， 或兩脅作脹， 或胸乳作痛， 或寒熱往來， 或小便不利， 飲食不入， 嘔吐痰涎， 神思不清， 此肝木乘脾土。 用小柴胡加山梔、炮薑、茯苓、陳皮、制黃連，
（“制黃連， 即黃連、吳茱萸等分， 用熱水拌濕醃二、三日， 同炒焦， 取連用”）
分析本案處方， 實為小柴胡湯、半夏瀉心湯、二陳湯三方合方加減（如果把“制黃連”看作左金丸法， 則為四方化裁）。 如果治療外感病， 如果從六經辨證法用方， 小柴胡湯不該有這種用法。 而治療內傷病， 用臟腑辨證法用方， 本案中小柴胡湯的這種用法似乎非常自然、合理。
《內科摘要》中記錄小柴胡湯的主治， 側重於內傷病， 可參考：“小柴胡湯：治肝膽症， 寒熱往來， 或日晡發熱；或潮熱身熱， 默默不欲食；或怒火口苦耳聾， 咳嗽發熱， 脅下作痛， 甚者轉側不便， 兩胠痞滿；或泄瀉咳嗽；或吐酸食苦水；或因怒而患瘧痢等症。 ”
