口腔潰瘍雖然在日常生活中極為常見，
也具有一定自限性，
但也常是局部疾病和全身疾病在口腔的表徵，
由於潰瘍的表現基本一致，
要查明病因還需仔細進行鑒別。
1、手足口病：好發于兒童，
患兒體溫可升高至38℃，
口腔黏膜的任何部位均可發生皰損，
粟粒大小，
密集或散在分佈，
皰破後形成的潰瘍可達綠豆或黃豆大小，
潰瘍周圍有紅暈圍繞。
此外患兒手、足底等部位的皮膚也可出現粟粒大小的紅斑、丘疹和小水皰。
2、梅毒：患者感染梅毒7-10周後由於螺旋體的感染和毒素作用，
可出現黏膜斑損害，
好發於頰、齦、舌齶、懸雍垂，
3、鱗癌潰瘍：癌性口腔潰瘍好發於舌腹舌緣、口角、軟齶複合體， 潰瘍深淺不一， 邊緣不齊， 底部菜花狀周圍及基底硬。 此類口腔潰瘍常伴有惡病質， 有助於診斷。
4、皰疹性口炎：皰疹性口炎多見於嬰幼兒， 患兒口腔可出現簇狀小皰疹， 很快破潰形成成簇的淺表小潰瘍， 疼痛劇烈， 頜下淋巴結腫大， 同時伴有發熱、寒戰等全身症狀。
5、帶狀皰疹病毒引起的口炎：帶狀皰疹病毒引起的口炎多見於中老年， 患者口腔黏膜皰破後形成潰瘍， 皮膚皰破後結痂。
