在某些自然的或實驗條件下， HPV病毒誘發的尖銳濕疣雖具有轉化為癌的傾向， 然而這種轉化率病不高， 不是所有的HPV感染者都會進展為癌。 對於大多數患者而言， 這種轉化還需要其它輔助因數的存在， 例如吸煙、化學物質、宿主因素（例如HIV感染）和環境協同因素等， 均對尖銳濕疣轉為惡性腫瘤有致突變及啟動作用。 從臨床情況而言， 尖銳濕疣的癌變趨向可能與以下幾種因素有關：
1、免疫功能降低或身體衰弱時的人體易患尖銳濕疣， 而癌症的發生也與免疫功能有關， 加上某些原因啟動癌基因、免疫狀態改變和某些致癌物質作用，
2、機體免疫功能下降， 復發率高， 採取多種有效治療措施， 仍不能有效控制復發的皮損， 可能向惡性化發展。
3、肛門、直腸及肛周等部位的巨大尖銳濕疣是高度進展性腫瘤， 具有復發和惡變特性， 尤其是向皮膚深層浸潤生長時， 惡變的可能性更大。
然而一般尖銳濕疣患者， 都是早發現早治療， 不會發展成巨大尖銳濕疣;並且沒有合併其他慢性免疫性疾病， 免疫能力並不是非常低下;不是長期鐳射強烈刺激或冷凍刺激局部， 也不會形成皮損長期不愈、潰瘍、浸潤糜爛、和繼發感染等慢性刺激。
就女性而言， 一般只有感染了高危型的HPV， 宮頸癌及宮頸上皮內才有可能發生高度病變或者癌變。 但是， HPV的感染、潛伏是一個長期的過程， 它可以潛伏在細胞內若干年。 從HPV感染發生病變到發展成宮頸癌， 中間有大約10年左右的時間， 在此期間只要婦檢做防癌篩查， 都可以查出癌前病變， 及時治療， 避免悲劇的發生。
另外， 有資料顯示， 在對一組442例尖銳濕疣患者組織學觀察結果表明， 患鱗狀上皮增生93例占總術的21%， 上皮不典型增生31例占總數的7%， 鱗癌變2例占總數的0.45%。 就像吸煙會誘發癌症一樣， 吸煙的人都知道這一點， 但卻並不在意， 甚至連戒煙的想法也沒有。 因為吸煙會致癌， 我們可以通過常識會判斷這個比例是多少，
尖銳濕疣是可以誘發癌變， 但這個比例非常低。 這和吸煙會導致癌變的比例都很接近。 絕大多數尖銳濕疣並不會癌變。 因此， 尖銳濕疣患者不必為此而整天擔心憂慮， 更不要心理過於恐慌。 只要積極科學的治療， 就一定可以康復的。
