以前人們普遍認為乙肝大三陽表示乙肝病毒感染， 複製活躍， 有傳染性。 乙肝小三陽則表示肝炎病情好轉， 乙肝病毒複製停止， 沒有傳染性。 但大量研究表明， 真正決定乙肝小三陽患者病情輕重的是乙肝病毒DNA、肝功能和肝纖維化程度。
目前臨床上發現一種惡性乙肝小三陽， 其乙肝病毒DNA高水準複製（PCR檢測大於105拷貝/毫升）， 且肝功能不正常， 可以稱為e抗原陰性的慢性乙肝。 這種惡性乙肝小三陽是由於乙肝病毒變異所致， 它使得人體內免疫系統無法識別、清除， 隱蔽性更強、危害性更大， 其發展為肝硬化、肝癌的比例更高。
專家強調， 對於e抗原陰性的乙肝小三陽的治療， 抗病毒是關鍵， 免疫治療乙肝小三陽是重點， 通過免疫調節以啟動內源性細胞因數， 再配合抗病毒藥物， 可以最大限度地抑制或清除乙肝病毒， 減輕肝細胞炎症壞死及其所致的肝纖維化， 減少肝硬化、肝癌的發生， 從而達到治療乙肝小三陽的目標。
根據患者的條件採取中西醫結合治療或純中藥治療， 多能取得較滿意的療效。 若中西結合治療：中藥製劑“肝胃欣膠囊”（“肝複欣膠囊”）、“丹參強肝膠囊”（“銀柴強肝膠囊”）、“酶清丸”， 採用“複方同步療法”， 不同時間服用。
對於肝病小三陽的治療效果：張XX， 男， 46歲， 患者86年體檢發現乙肝“小三陽”之後間斷治療。 曾服用“肝泰樂”等中西藥物， 2002年9月份出現肝區不適， 眼乾澀、乏力， 於2002年10月3日就診。 B超示：慢性肝病、輕度脂肪肝、膽囊炎、脾厚4.4cm;肝功正常， 乙肝“小三陽”。 門診口服護肝降脂膠囊、強肝膠囊、清肝利膽膠囊等， 於2003年9月26日複查HBV-DNA陰。
