尿路結石形成急性尿路梗阻時， 臨床表現較為典型， 其診斷並不困難， 原發性尿路結石往往與某些疾病容易混淆， 須與之鑒別的疾病有：
1.尿道狹窄尿道狹窄 主要症狀為排尿困難， 尿流變細無力， 中斷或滴瀝， 併發感染時亦可有尿頻， 尿急， 尿痛及尿道分泌物， 某些外傷性尿道狹窄亦可能捫及尿道硬結。
尿道狹窄往往無腎絞痛史及尿砂石史， 而有其原發病因， 如損傷， 炎症或先天性， 醫源性等原因;其排尿困難非突發性;尿道探通術可於狹窄部位受阻;X線平片無結石陰影，
2.非特異性尿道炎非特異性尿道炎時， 可有尿痛， 尿頻， 尿急及尿道分泌物， 慢性非特異性尿道炎可併發尿道狹窄而出現排尿困難。
非特異性尿道炎無腎絞痛或尿砂石史， 無急性排尿困難， 尿道捫診不能觸及硬結， X線檢查無結石陰影。
3.尿道損傷尿道損傷可有尿道外口出血， 尿道內疼痛及排尿困難， 尿瀦留， 併發感染時可有尿道分泌物。
尿道損傷一般有明確損傷史， 常伴尿外滲， 局部皮膚腫脹， 皮下瘀血， 試插導尿管不易插入膀胱， 並可由導尿管引出數滴鮮血， X線平片可見骨盆骨折等徵象， 無結石陰影。
4.尿道痙攣由於尿道括約肌痙攣， 可有尿道疼痛和排尿困難等症狀， 往往由精神緊張， 局部刺激等因素引起。
尿道痙攣無尿砂石史及尿頻尿急等症狀， 不能捫及尿道硬結， 尿道探通術可正常通過， X線檢查無異常， 用鎮靜劑後症狀可緩解。
5.尿道異物尿道內異物引起尿道梗阻時， 可出現排尿困難， 甚至尿瀦留， 異物刺激或繼發感染時， 可有尿頻， 尿急， 尿痛及血尿。
但有其病因可尋.X線檢查可見尿道內充盈缺損， 尿道鏡檢查可見異物。
