肛瘺的初期症狀:
疼痛:瘺管通暢無炎症時常不感疼痛, 只感覺局部發脹和不適, 行走時加重。 當瘺管感染或膿液排出不暢而腫脹發炎時, 可引起疼痛。 內瘺時常感到直腸下部和肛門部灼熱不適, 排糞時感到疼痛。
流膿:膿液的多少, 因瘺管的長短、大小而不同。 新生成的肛瘺流膿較多, 膿稠, 味臭, 色黃, 以後逐漸減少, 時有時無, 呈白色, 質稀淡。 如忽然膿液增多, 表示有新瘺管生成。 有時外口暫時封閉, 流膿停止, 體溫上升, 局部腫脹, 再度形成膿腫。 封閉的外口再穿破或形成另一新外口, 又有膿液流出。 內外瘺粗大者,
可見全身症狀:一般肛瘺常無全身症狀, 但複雜性肛瘺和結核性肛瘺, 因病期長, 有的帶病數十年, 常出現身體消瘦、貧血、便秘和排便困