骨腫瘤分類是基於細胞來源， 特別是根據腫瘤細胞所顯示的分化類型及所產生的細胞間質類型進行的。 1993年世界衛生組織（WHO）公佈的骨腫瘤的分類法如下：
1、良性
良性骨腫瘤包括：①成骨性腫瘤：骨瘤、骨樣骨瘤、骨母細胞瘤等；②成軟骨性腫瘤：骨軟骨瘤（最常見）軟骨瘤、內生軟骨瘤等；③脈管腫瘤：血管瘤、球瘤等④瘤樣病變：孤立性骨囊腫、骨化性肌炎等⑤其他， 如破骨細胞瘤、骨髓腫瘤、脂肪瘤、神經鞘瘤等等。
2、中間性
中間性腫瘤包括：①侵襲性骨母細胞瘤②血管內皮瘤③血管外皮瘤④韌帶樣纖維瘤⑤動脈瘤樣骨囊腫⑥嗜酸性肉芽腫⑦甲狀旁腺功能亢進性棕色瘤。
3、惡性
惡性腫瘤包括：①骨肉瘤：髓性骨肉瘤、骨內高分化骨肉瘤、骨膜骨肉瘤等；②軟骨肉瘤:骨膜軟骨肉瘤、間葉性軟骨肉瘤、透明細胞軟骨肉瘤等；③脈管腫瘤：血管肉瘤、惡性血管外皮瘤；④結締組織腫瘤：纖維肉瘤、脂肪肉瘤、惡性間葉瘤、平滑肌肉瘤、脊索瘤等⑤骨髓腫瘤：尤文肉瘤、骨原始神經外胚層瘤、骨惡性淋巴瘤、骨髓瘤。
