強直性脊柱炎的病因目前尚未完全明確, 大多認為遺傳、感染、免疫環境因素等有關。
遺傳因素
遺傳因素在強直性脊柱炎的發病中具有重要作用。 有報導, 強直性脊柱炎一組親屬患強直性脊柱炎的危險性比一般人高出20~40倍, 國內調查強直性脊柱炎一級親屬患病率為24.2%, 比正常人群高出120倍。
感染因素
近年來研究提示強直性脊柱炎發病率可能與感染相關。 Ebrimger等發現強直性脊柱炎病人大便中肺炎克雷白菌檢出率為79%, 而對照組肺炎克雷白菌的攜帶率及血清中針對該菌的IgA型抗體滴度均較對照組高,
自身免疫因素
有人發現60%強直性脊柱炎病人血清補體增高, 大部分病例有IgA型類濕因數, 血清C4和IgA水準顯著增高, 血清中有迴圈免疫複合物, 但抗原性質未確定。 以上現象提示免疫機制參與本病的發病。
其它因素
創傷、內分泌、代謝障礙和變態反應等亦被疑為發病因素。 總之, 目前本病病因未明, 尚無一種學說能完滿解釋強直性脊柱炎的全部表現, 很可能在遺傳因素的基礎上的受環境因素等多方面的影響而致病。