對於臨床懷疑而普通X線檢查不能確診的強直性脊柱炎患者, 可以行CT檢查。 CT能清晰顯示骶髂關節間隙, 便於測定關節間隙有無增寬、狹窄、強直或部分強直。
美國科學家研究了36例患者, 24例為炎性下背痛, 12例為機械壓力所致下背痛的患者, 通過標準的X線檢查骶髂關節正常。 但應用MRI檢查發現54%的炎性下背痛和17%的機械原因性下背痛的患者有骶髂關節炎。 用單光子發射電腦斷層掃描(SPECT)檢查發現38%的炎性下背痛存在骶髂關節炎, 而機械原因組無此發現。 MRI和SPECT同時檢查陽性發現率明顯升高, 炎性下背痛者58%和機械性下背痛者1796的患者存在骶髂關節炎。