不同的個體愛滋病窗口期所表現的症狀有所不同， 男性患者愛滋病窗口期與女性相比存在一定的區別。 然而事實同時也證明， 男性患者愛滋病視窗期症狀較女性輕微， 不明顯。
美國愛滋病控制與防治中心發現， 當男性和女性夫妻生活次數和性夥伴範圍近似的情況下， 一般只有一種HIV病毒感染男性， 而會有數種其他病毒感染女性。 因此， 女性患者窗口期症狀發作比較快。
但不論男女， 愛滋病死亡率總是差不多。 愛滋病視窗期的症狀起初令研究人員大惑不解， 後來發現答案是男女生理構造不同，
而作為反擊， 愛滋病毒把T細胞作為主要打擊對象。 女性先天帶有比較多的T細胞， 這使女性對愛滋病病毒特別敏感， 愛滋病視窗期的症狀也發生比較劇烈。 這絕對是件壞事， 由於大量的T細胞對愛滋病毒進行了強大的抗擊， 迫使愛滋病毒加快變異速度， 愛滋病視窗期的症狀出現也會隨之加快，
最終結果是， 女性體內的一種愛滋病病毒不久就變異為數種， 這種情況在感染後的愛滋病視窗期的症狀特別明顯。 因此女患者攜有的病毒總數量不多， 可是愛滋病視窗期的症狀危害絲毫不減。 這項研究成果把藥品公司驚出一身冷汗。 因為這若是事實， 女性身體上出現的愛滋病視窗期的症狀讓名噪一時的“雞尾酒”療法和其它特效藥黯然失色。
通過男女患者愛滋病視窗期症狀上存在的差異， 在治療方向上也會採取不用的方法。
