肛瘺最常見的症狀就是肛門疼痛， 會有反復的流膿症狀， 在這一疾病的初期流膿會多一些， 一定要儘早治療， 除了手術治療， 中醫治療肛瘺的效果也很好， 通過中醫內治辯證治療能夠治癒疾病。
一、內治法， 辯證論治
1.濕熱下注
治法：清熱利濕， 活血止痛。
方藥：止痛如神湯或化毒除濕東加減。 黃柏， 銀花， 丹皮， 赤芍， 茯苓， 生薏仁， 蒼術， 歸尾， 枳殼， 通草， 生甘草。 若便秘者加大黃、火麻仁;痛甚者加元胡、防風。
2.正虛邪戀
治法：扶正祛邪。
方藥：托裡消毒散加減或十全大補湯合五味消毒飲。 黨參， 黃花， 當歸， 白術， 茯苓， 桔梗，
3.陰液虧虛
治法：清熱養陰。
方藥：秦艽鱉甲東加減， 秦艽克， 鱉甲， 銀柴胡， 地骨皮， 全當歸， 青蒿， 知母， 烏梅， 炙甘草。
二、單方驗方
1.土貝母、雄黃。 共研細末後， 用桐油調成糊狀備用。 適用于結核性瘺管， 有脫腐生肌之作用。
2.露蜂房、白芷， 或大腹皮、生大黃， 將二味藥煎水外洗， 適用于肛瘺初起者， 可緩解症狀， 有消腫止痛散瘀之作用。
3.防風、黃芩、龍膽草、苦參， 魚腥草、生大黃， 加水煎湯熏洗或坐浴。
4.紅粉， 朱砂， 加生石膏。 將上藥製成油紗布條外用。 適用于瘺管術後， 殘留管壁未消及胬肉增生， 有化腐生肌的作用。
5.鮮榆白皮、白糖各15克。 二味放入石臼內搗爛， 搓條如針狀，
6.大黃、黃柏各， 薑黃， 白芷， 川樸、陳皮、甘草、蒼術、南星， 天花粉。 上藥共研細末， 與凡士林配成20%軟膏外敷。 適用於肛瘺發炎， 有清熱除濕， 消腫止痛的作用。
7.大生地， 黃連， 黃柏、當歸尾， 紫草， 黃蠟， 香油。 將前五味藥入銅鍋或鋁鍋， 香油浸泡24小時後， 把鍋放火上， 先用文火， 後用武火， 把藥熬枯， 過濾去渣， 再入黃蠟佯化， 攪勻放涼， 收膏裝瓶備用。 適用於肛瘺術後， 創面水腫或瘺管發炎者， 有清熱解毒止痛之功.
