系統性紅斑狼瘡的治療以內用藥物治療為主， 常用的藥物有非甾體類抗炎藥、抗瘧藥、腎上腺皮質激素和免疫抑制劑等幾類， 臨床應用時根據患者的病情、全身情況等制定個體化的用藥方案。
1、非甾體類抗炎藥
包括布洛芬、怡美力、莫比可、扶他林、奧斯克等等， 可用於緩解系統性紅斑狼瘡患者的發熱、關節腫痛、肌肉酸痛、乏力等症狀， 應用非甾體類抗炎藥可在一定程度上減少腎上腺皮質激素的用量及副作用， 但肝腎功能異常的患者應慎用。
2、抗瘧藥
包括氯喹和羥氯喹， 適用於發熱、關節炎、皮疹嚴重的患者，
3、腎上腺皮質激素
常用的藥物有潑尼松、甲潑尼龍等， 適用於急性發病、病情重、其他方法不能有效控制的非感染性狼瘡高熱、血細胞驟減、腎炎、中樞神經系統病變、間質性肺炎及重度肝炎。 臨床應用時需根據患者的病情、全身狀況等因素確定藥物用量、給藥途徑及使用療程， 多用短期大劑量靜脈衝擊療法合併口服維持療法， 用藥過程中要加強監測，
4、免疫抑制劑
常用的藥物有環磷醯胺、硫唑嘌呤、苯丁酸氮芥、雷公藤多甙和環孢素等， 適用於重症、不適宜用大劑量腎上腺皮質激素和難治性系統性紅斑狼瘡患者。
