牙痛。 不少患者將三叉神經痛誤認為牙痛, 甚至前往口腔科將健康牙齒拔除, 更有甚者將全部牙齒拔除仍無效, 故應注意。 牙病引起的疼痛為持續性疼痛, 多局限於齒齦部, 局部有牙痛及致病病變, X線及牙科檢查可以確診。
副鼻竇炎。 如額竇炎、上頜竇炎等, 為局限性持續性疼痛, 可有發熱、鼻塞、濃涕及局部壓痛等。
青光眼。 單側青光眼急性發作誤診為三叉神經第1支痛。 青光眼為持續性痛, 不放射, 可有嘔吐, 伴有球結合膜充血、前房變淺及眼壓增高等。
顳頜關節炎。 疼痛局限於顳頜關節, 呈持續性, 關節部位有壓痛, 關節運動障礙, 疼痛與下頜動作關係密切, 可行X線及專科檢查協助診斷。
偏頭痛。 疼痛部位超出三叉神經範圍, 發作前多有視覺先兆, 如視力模糊、暗點等, 可伴嘔吐。 疼痛為持續性, 時間長, 往往半日, 甚至1-2 日。
三叉神經炎。 病史短, 疼痛呈持續性, 三叉神經分佈區感覺過敏或減退, 可伴有運動障礙, 在受累的三叉神經分支有明顯壓痛。 神經炎多在感冒或副鼻竇炎後發病。
小腦腦橋角腫瘤。 疼痛發作可與三叉神經痛相同或不典型, 但多見於30歲以下青年人,
腫瘤侵犯顱底。 最常見為鼻咽癌, 常伴有鼻衄、鼻塞, 可侵犯多數腦神經, 頸淋巴結腫大, 做鼻咽部檢查、活檢、顱底X線檢查, CT及MRI檢查可確診。