出現睾丸疼痛， 診斷睾丸扭轉的話， 需要與以下幾種疾病進行鑒別：
1.嵌頓疝 病人既往有腹股溝斜疝的病史。 腹股溝斜疝嵌頓時， 陰囊部可有劇烈的疼痛， 並伴有明顯的壓痛。 腹部也有壓痛， 且伴有噁心嘔吐、停止肛門排便及排氣等症狀。 聽診可聞及腸鳴音亢進、有氣過水聲。 睾丸及附睾檢查無異常。
2.急性睾丸炎及附睾炎 可有睾丸疼痛等症狀， 伴發熱、白細胞增高。 多見於成人， 發病較慢， 疼痛症狀較輕
3.輸尿管結石 表現為突發性腰腹部絞痛， 並可放射至股部、會陰部、陰囊， 伴噁心、嘔吐， 但陰囊及其內容物均正常。
4.睾丸附件扭轉 睾丸附件扭轉的臨床症狀與睾丸扭轉相似， 也可發生噁心、嘔吐、腹部不適的症狀。 發病一般較緩和， 在一兩天內逐漸加重， 但也有疼痛劇烈、急性發作的。 體格檢查可在睾丸的上極觸及腫塊。 臥床休息、應用非激素類抗炎藥物、托起陰囊可使症狀得到緩解。
5.陰囊血腫：這類病人主要有明顯的外傷史。
6.鞘膜積液：這是一種慢性發展的疾病， 一般情況下不會很痛。
7.睾丸附睾扭轉：這類疾病一般是青年人多發。
如果患者出現睾丸腫脹， 不發燒， 醫生就會懷疑可能是睾丸扭轉， 要立即進行探查手術。
還應與精索靜脈曲張、特發性陰囊水腫、脂肪壞死、病毒感染相鑒別。
