晚期肝硬化患者由於肝功受損， 往往伴有嚴重營養不良、低蛋白血症， 此時用一些腸外營養藥物是有益的。 但是， 肝硬化患者一旦出現肝性腦病或肝性腦病前兆， 各種氨基酸製劑就不能隨便使用了。 肝硬化患者由於腸道菌群失調， 食欲下降， 導致機體營養物質攝入、吸收減少， 容易導致低蛋白血症， 使用複合氨基酸製劑可以起到補充人體必需氨基酸， 糾正負氮平衡的作用， 對患者是有益的。 但是肝硬化一旦出現肝性腦病， 證明肝臟功能已經進入了衰竭狀態， 此時肝臟無能力代謝體內蛋白質分解產生的氨，
正常人體內的支鏈氨基酸和芳香族氨基酸的比例是一定的， 這種正常的比例維持著大腦正常的興奮和抑制， 使人保持睡眠與覺醒。 但是， 晚期肝硬化高氨血症患者由於氨的刺激， 使機體胰島素和胰高血糖素分泌失衡， 導致支鏈氨基酸減少而芳香族氨基酸增多。 芳香族氨基酸進入腦組織， 使5-羥酪胺、苯乙醇胺等假性神經遞質增多， 從而刺激大腦產生肝昏迷。
有的複合氨基酸製劑不但包含支鏈氨基酸， 還包含了更多的芳香族氨基酸， 如果不加選擇地使用這種複合氨基酸製劑， 會使支鏈氨基酸與芳香族氨基酸的比例更加失衡， 加重患者的肝昏迷。 因此， 多種複合氨基酸製劑在藥品說明書中明確提示，
