肛管直腸瘺主要侵犯肛管， 很少涉及直腸， 故常稱為肛瘺， 是與會陰區皮膚相通的肉芽腫性管道， 內口多位於齒線附近， 外口位於肛周、皮膚處。 整個瘺管壁由增厚的纖維組織組成， 內複一層肉芽組織， 經久不愈。 發病率僅次於痔， 多見於男性青壯年， 可能與男性的性激素靶器官之一的皮脂腺分泌旺盛有關。 肛門直腸周圍膿腫是引起肛瘺的根本原因。 膿腫破潰或切開後不能癒合， 最終形成瘺管， 其主要原因：
①肛門直腸周圍膿腫破潰或切開多在肛門外， 膿液從外口流出， 但原發感染多在肛竇。 肛竇則是繼發感染的門戶，
②瘺道多在肛門括約肌之間通過， 由於括約肌經常不斷地收縮與舒張， 壓迫瘺道， 影響膿液的排除， 容易貯膿感染而難以癒合。
③直腸內有一定的壓力， 將直腸感染物質如糞便、氣體， 可經常不斷地從內口進入瘺道， 刺激腔壁， 繼發感染後由外口排出， 也是造成瘺道的原因。
④肛門直腸周圍膿腫破潰後， 膿液排出， 膿腔逐漸縮小， 外部破潰口和切口也縮小， 腔壁形成結締組織增生的堅硬管道壁， 因而不能自然閉合。
⑤瘺道彎曲、或有竇、分支， 引流不通暢， 膿液瀦留， 反復感染， 造成瘺道不易癒合。
⑥肛門靜脈回流不暢， 局部經常淤血， 組織營養不良， 影響癒合。
⑦結核桿菌、放線菌等感染所形成的膿腫，
