許多疾病會在清晨階段表現出特有的症狀。
晨僵：晨僵指的是清晨醒後， 感覺全身關節、肌肉僵硬， 活動受限。 在逐漸活動中， 關節和肌肉才逐漸伸展開來。 如果清晨醒後有明顯的晨僵， 說明患者有類風濕、風濕、骨質增生等疾病。 一些過敏性疾病的患者， 如多形紅斑、皮肌炎、硬皮病等， 也會出現明顯的晨僵現象。
心慌饑餓：有些人在淩晨4時至5時從睡眠中醒後感到饑餓難忍， 心慌不適， 還伴有疲乏無力。 食後症狀緩解， 但仍口乾舌燥、想喝水。 這些症狀在吃早飯後逐漸消失。 這提示患者可能患有糖尿病。
早醒：有些老年人在早晨4時至6時即從睡夢中醒來。
頭暈：頸椎骨質增生可能壓迫椎動脈， 影響大腦血液供應；而血黏度增高時， 血流減慢， 血氧含量下降， 大腦供血供氧也受到不良影響。 所以， 早晨頭暈者多數有頸椎病或高黏血症。
