要瞭解為什麼會出現月經紊亂， 首先要從正常的月經週期來開始說起。
女性的月經是女性性成熟的一個標誌， 每個月， 子宮都在為懷孕做著提前的準備工作。 子宮內膜有一個功能層， 每個月在卵巢的雌激素的影響下開始生長， 到了月經中期長到一定的厚度， 為可能的受精卵做好了在子宮上的種植做準備， 在此後月經的後半期， 進入所謂的黃體期， 卵巢分泌孕激素， 支持可能的受精卵的發育， 如果沒有胚胎在子宮內的種植， 那麼準備好的子宮內膜就開始脫落， 形成月經。
子宮內膜的週期性改變，
卵巢的激素的週期性改變則是受上一級的中樞調控的， 這個“上級”是腦子裡面的垂體， 它週期性分泌FSH（促卵泡生成素）和LH（促黃體生成素）。
而同樣， 垂體是受上級來管理的， 它的上級是下丘腦， 下丘腦則是大腦中樞， 思維、精神因素都可能成為影響下丘腦的因素。
瞭解了這個下丘腦——垂體——卵巢——子宮內膜這一個垂直的軸， 就可以知道正常的月經是怎麼來的， 也就可以理解在月經紊亂的時候可能是發生了什麼問題。
通常情況下， 進入青春期後， 需要一段時間來建立月經的規律性， 這是正常現象， 一般情況下初潮後2-3年即可建立其規律性。
懷孕了的時候， 受精卵種植在子宮內膜上， 開始的時候需要卵巢的黃體的孕激素的支持， 到了絨毛生長後， 就由絨毛分泌的hCG（絨毛促性腺激素）來支撐黃體的生長和分泌孕激素， 這時候月經就不會來。 子宮將會繼續為胎兒的發育支持下去。
若沒有懷孕的情況， 月經推遲， 其它更為常見的是外界環境， 譬如天氣、精神、情緒、飲食、肥胖、藥物以及身體裡面其它疾病造成對下丘腦垂體卵巢功能軸的影響， 這樣的影響一般都是暫時的， 在去除了外因或者影響月經的疾病得到治療了以後， 通常月經就可以恢復其規律性，
這個軸的規律性如果長期得不到建立， 就會表現為月經的紊亂， 或者是月經週期長， 或者是月經一來好多天， 這樣的情況也是病態的情況。 長期如此， 也存在著身體過度受雌激素的刺激的影響， 有可能會增加子宮內膜癌症的風險。 所以若是有長期的紊亂， 需要進行藥物的調整。 對於年輕生育期的女性， 重在調整月經的規律性， 若有生育要求， 可能會使用藥物來進行促排卵。
