因多發性硬化症會侵犯神經纖維的髓鞘、故臨床症狀端看受損神經纖維為何而決定。 一般而言運動、感覺、以及視覺的影響都很常見；若腦幹及小腦系統的神經纖維受損、複視、吞咽困難、步履不穩、暈眩的症狀亦可能發生。 如果脊髓發炎、除了運動、感覺功能外、排泄的功能亦發生障礙。 少數病患還會有癲癇及智能障礙的發生。
多發性硬化症診斷的標準：
(1) 臨床證據：系指出現神經系統症狀及體征， 可有客觀證據， 也可無客觀證據。 可以完全是患者的主觀感覺或在病史中提供的， 也可為經醫生檢查發現的陽性體征。
(2) 病變的亞臨床證據：是指通過各種檢查發現的中樞神經系統病變。 這些檢查包括腦幹聽覺誘發電位、視覺誘發電位、體感誘發電位、影像學檢查及免疫學檢查等。
(3) 多發性硬化的典型症狀：為中樞神經系統白質受損的症狀和體征， 不累及灰質和周圍神經(除非是髓內部分引起者)。 頭痛、驚厥、抑鬱或意識障礙對多發性硬化的診斷無特殊意義。
(4)發作次數判定(時間)：2次發作間隔必需是1個月以上， 每次發作歷時必須超過24小時。
(5)病灶多發性判定(空間)：症狀和體征不能用單一的病灶解釋。 如同時發生雙側視神經炎或兩眼在15天內先後受累， 應視為單一病灶。 只有中樞神經系統明確存在不同部位(大腦、腦幹、小腦、視神經、脊髓)的損害， 才能認為是兩個以上的病灶。
