血管瘤的器官功能損害有：
視覺 眼眶周圍血管瘤對視覺影響較大， 特別是上眼瞼的血管瘤， 可造成難治性散光、近視、斜視。 球後毛細血管瘤可致盲。 晚期可造成上瞼下垂， 眼球突出。 下瞼血管瘤對視覺的影響較小。
呼吸系統 較大的舌及擤咽部血管瘤可阻塞呼吸道， 大面積的頸部血管瘤可以壓迫氣管， 產生嚴重的呼吸困難， 嚴重時可導致患兒窒息死亡。
聽覺 位於腮腺處的血管瘤可阻塞外耳道， 導致不同程度的傳導性聽力喪失。 如果血管瘤不能自行退化， 長期影響小兒聽力， 可影響其語言能力的形成。
充血性心力衰竭 為多發性皮下和內臟血管瘤患兒的致命併發症。 無內臟血管瘤的多發皮下血管瘤心力衰竭的發生率不高， 但由於廣泛細小的動、靜脈異常交通， 可產生顯著的周圍血管阻力降低， 因而使心搏出量明顯增加， 出現氣急、心率加快和心臟增大。
骨骼損害及肢體畸形 主要發生在大面積的肢體和頭面部海綿狀血管瘤。 由於在患肢深層組織和骨骼周圍存在尤泛的動靜脈吻合支， 以致血流量增加， 骨髓內迴圈豐富， 血氧增加， 促使患肢增粗增長。 骨骼血管瘤並可產生骨質破壞性改變， 繼之可產生病理性骨折。
