小兒缺鐵性貧血的治療原則與成人缺鐵性貧血的治療相同, 即以補充鐵劑為主。 小兒鐵劑治療可以採用同樣的含鐵藥物, 如硫酸亞鐵、富馬酸鐵、葡萄酸亞鐵、琥珀酸亞鐵或血紅素鐵等。 小兒鐵劑的應用劑量以元素鐵進行計算, 每日每公斤體重6mg, 折算成硫酸亞鐵為每日30mg, 每日量分2次或3次口服。 硫酸亞鐵對胃腸道有刺激, 可以引起噁心、食欲不振、甚至嘔吐, 這類反應在年齡較大者發生多, 年齡越小發生越少。 為減少反應, 可以飲後服藥。 服藥後反應重的小兒可以適當減少服藥劑量。 服藥至血紅蛋白達正常水準以後2個月再停藥,
一般的小兒缺鐵性貧血不需要輸血治療。 重度貧血伴有心功能不全時輸血可以使心功能不全得到較快改善。 缺鐵性貧血合併較重感染者也要給予輸血, 以保證感染的治療能夠順利進行。 小兒輸血量與貧血程度有關, 貧血越重, 每次輸血量越小, 輸血速度也要越慢。
最後應當注意的是, 要去除引起缺鐵性貧血的原因, 比如改善餵養情況等。