1、鼻咽部淋巴肉瘤 淋巴肉瘤好發于青年人， 原發腫瘤較大， 常有較重鼻塞及耳部症狀， 該病淋巴結轉移， 不單局限在頸部， 全身多處淋巴結均可受累， 顱神經的損傷不如鼻咽癌多見， 最後需要病理確診。
2、增生性病變 鼻咽頂壁、頂後壁或頂側壁見單個或多個結節， 隆起如小丘狀， 大小約0.5～1cm， 結節表面粘膜呈淡紅色， 光滑， 多是在鼻咽粘膜或腺樣體的基礎上發生， 亦可由粘膜上皮鱗狀化生後， 角化上皮瀦留而形成表皮樣囊腫的改變， 部分是粘膜腺體分泌旺盛， 形成瀦留性囊腫。 當結節表面的粘膜出現粗糙、糜爛、潰瘍或滲血，
3、鼻咽部結核 患者多有肺結核病史， 除鼻阻、涕血外， 還有低熱， 盜汗、消瘦等症， 檢查見鼻部潰瘍、水腫、顏色較淡；分泌物塗片， 可找到抗酸桿菌， 可伴有頸淋巴結核；淋巴結腫大， 呈馬鈴狀， 粘連， 無壓痛， 頸淋巴結穿刺可找到結核核菌， CT試驗強陽性， X線胸片常提示肺部活動性結核灶。
4、 咽粘膜炎症 表現為粘膜粗糙， 尤其是重度炎症時， 鼻咽粘膜濾泡增殖， 表面凹凸， 甚至可呈桑椹樣， 表面附有膿性分泌物， 常需與粘膜浸潤性癌相鑒別。
5、過敏性鼻炎 鼻咽粘膜蒼白、光滑呈水腫樣。
6、萎縮性鼻炎 鼻咽頂前粘膜有淺在性潰瘍， 周圍有膿性分泌物， 需與潰瘍型鼻咽癌鑒別。
