99％以上的拔牙本身不會發生問題， 只有極少數情況下會發生設部殘留。 尤其是牙根毀壞明顯的牙齒， 有時會出現毀壞後根部殘留在血液及肉芽中的情況。 雖然不會特別疼痛， 但數月後， 牙齦內的突出物會使臉部浮腫， 舌頭觸碰時會有異樣感。 這時， 是否使用麻醉劑要視情況而定， 醫生可用鑷子等器具完成簡單的處理工作。
彎曲的牙根前端斷裂後， 就取不出來了， 因為它原本是健康牙齒的一部分， 所以只能將這部分完整取出。 但偶爾有殘留牙根發生斷裂以及含有大量神經的情況， 這時候有可能會導致縫隙中污垢殘留從而引發炎症，
將牙齒損傷控制在最小範圍內的方法有“斷尾法”和“分離法”。 這兩種都是應對大臼齒的處理方法， 多用於位於下顎的臼齒。 “斷尾法”是將牙齒分割成兩半， 只將無法保存的牙根部分取出。 “分離法”用於牙骨部位有破損和斷裂時， 污垢殘留、炎症反復發作的情況。 分陽法同樣將牙齒分割成兩半， 擴充易積攢污垢的縫隙， 使污垢難以殘留。
如果牙齒像盲腸一樣可以放棄， 那拔牙就是最值得信賴的方法。 它與造成炎症的常在菌的種類及數量無關， 是確實可以抑制炎症發生的治療方法。
