甲板的形態、質地和顏色的改變並不都是灰指甲， 全身營養或局部血液迴圈的變化都能影響甲板的生長和發育而產生甲病。 不同的疾病可以引起相同的甲板損害， 而同一疾病又可引起不同的甲板損害， 故僅根據外觀不能鑒別。 灰指甲應與其他甲病相鑒別， 如銀屑病、濕疹、扁平苔蘚引起的甲改變以及甲營養不良的厚甲症等。 主要靠病甲的真菌學檢查來進行鑒別。 此外， 系統性疾病所致的甲改變也應有相應的皮膚症狀。 灰指甲診斷時需考慮多方面因素。
一、皮膚病所致的甲病
1.銀屑病：最常見為點狀凹陷、甲下角質增生，
2.濕疹：多見為甲橫紋、甲板汙黃色、高低不平、甲肥厚等。
3扁平苔蘚：約占患者的10%， 有時僅累及甲板。 多表現為甲縱脊、點狀凹陷、脆甲等。 典型損害為甲胬肉， 可形成永久性無甲。
4.斑禿：表現為甲營養不良， 如甲板破損、縱裂、斑點、橫紋、反甲、甲分離、點狀凹陷、甲板變薄、甲板增厚、甲脫落、甲板鬆動等。 甲營養不良的程度與脫髮程度成正比， 但不代表預後的好壞。
5.其他需要鑒別的還有許多皮膚病， 如線狀苔蘚、毛髮紅糠疹、大皰性疾病、多形紅斑、連續性肢端皮炎、Reiter綜合征等。
二、其他疾病所致的甲改變
1遺傳性甲病、先天性無甲症、槌狀甲、反甲、球拍狀甲、週期性甲剝離、先天性外胚葉發育不良表現為與甲有關的各種遺傳性綜合征等。
2.感染性甲病真菌、細菌、螺旋體、病毒、蟎等。
3.甲腫瘤：
良性腫瘤。 黏液囊腫、纖維瘤、球狀瘤、角化棘皮瘤等。
惡性腫瘤。 黑色素瘤、鱗癌、基底細胞癌等。
4.免疫反應所致甲病藥物過敏、血清反應等。
5.物理性、化學性或機械性甲損傷嵌甲、甲下出血、脆甲、甲破碎、甲層裂、甲過度彎曲、鉤甲、厚甲、縱裂、縱脊等。
鑒別依據應考慮上述各種皮膚病的特點， 並在甲外皮膚上有其典型表現;若僅累及甲板則鑒別十分困難， 鑒別主要依賴甲板的真菌學檢查。
