一般來說， 剛栽培的野生蔬菜抗病能力強， 但魚腥草人工栽培後， 其營養條件得以改善， 植株生長旺盛， 纖維減少， 糖分增加， 柔嫩多汁， 抗病能力大大降低。 目前已經發現魚腥草有少量病蟲危害。 病害以白絹病、紫斑病為主， 葉斑病、根瘤病也有發生， 蟲害主要是蠐螬。
1、白絹病 主要為害地下莖， 病部初期呈褐色斑塊， 表面遍生白色絹絲狀菌絲， 逐漸軟腐。 後期病部表面及附近土壤中發生大量菌核， 病株莖葉迅速凋萎， 甚至全株死亡， 防治措施主要是：注意排水， 增施磷鉀肥， 加強管理， 提高植株抗病力。 及時挖除病株，
2、根瘤病 根尖開始發病， 初生褐色不規則形小斑點， 後變黑色， 病斑逐漸擴大， 最後根系腐敗枯死， 葉片捲縮。 防治法：注意排水， 燒毀病株， 實行輪作。 播種時， 種莖用1：1：100的波爾多液浸泡10分鐘或用20％石灰水浸泡l小時， 進行消毒。 發病初期， 每667平方米用五氯硝基苯0．5千克拌細土15千克， 撒在根部周圍或用50％托布津l千克加水500千克灌根。
3、紫斑病 一般為害葉片， 發病初期， 病斑圓形、淡紫色、稍凹陷， 潮濕時病斑上出現黑黴， 並有明顯的同心輪紋， 以後小病斑連成不規則大斑，
4、葉斑病 長中、後期經常大量發生， 為害葉片。 發病時， 葉面出現不規則形或圓形病斑， 邊緣紫紅色， 中間灰白色， 上生淺灰色黴。 嚴重時， 幾個病斑融合在一起， 病斑中心有時穿孔， 葉片局部或全部枯死。 防治法：實行輪作， 最好水旱輪作。 播種前， 用50％多菌靈500倍液浸泡種莖24小時， 進行消毒。 發病時， 用50％托布律800～1000倍液或70％代森錳鋅400～600倍液噴霧。
另外， 防治蠐螬、黃螞蟻， 可用90％敵百蟲800～1000倍液灌根毒殺。
