現代醫學對多囊卵巢綜合症的病因病理尚未完全明瞭， 一般認為與下丘腦一垂體一卵巢軸調節功能異常、高胰島素血症和胰島素抵抗， 腎上腺內分泌異常以及遺傳因素有關。 其內分泌特點為雄激素和黃體化激素分泌過多以及雌激素的分泌異常。
下丘腦一垂體一卵巢軸調節功能異常
由於精神緊張、藥物及某些疾病影響到下丘腦一垂體的內分泌功能， 垂體對Gn-RH敏感性增加， 分泌過量LH及卵巢中作為雄激素形成酶的細胞色素的功能失調， 導致卵巢間質、卵泡膜細胞產生過量雄激素。 LH呈持續高水準，
胰島素抵抗和高胰島素血症
部分多囊卵巢綜合症患者， 尤其是肥胖患者可表現為高胰島素血症和耐胰島素， 提示由胰島素抵抗引起。 嚴重的胰島素抵抗患者可發生雄激素過多、胰島素抵抗和黑棘皮症綜合征， 表現為高條酮和高胰島素狀態， 黑棘皮症是胰島素抵抗的標誌。
腎上腺功能異常
50%的多囊卵巢綜合症患者中存在脫氫表雄酮DHEA升高， 腎上腺中合成街體激素的關鍵酶活性增加， 以及腎上腺細胞對促腎上腺皮質激素（ACTH）敏感性增加及功能亢進有關。 腎上腺皮質功能亢進， 分泌過量的雄激素可出現無排卵和類似多囊卵巢的症狀。
●遺傳因素
多囊卵巢綜合症發生所顯示的家族高度聚集性， 提示其病因學上一個主要因素可能為遺傳因素。 雖然已有證據提示， 與PCOS發病相關的候選基因， 位於胰島素受體基因；編碼膽固醇側鏈裂解酶的細胞色素基因；性激素結合蛋白基因等， 但還未找到特異的PCOS基因， 可能PCOS與多個基因異常有關。 少數多囊卵巢綜合征有染色體異常。
以上就是引起多囊卵巢綜合症的原因， 可單獨引起也可多個因素存在而引起， 需要檢查明確在針對性的治療。
