儘管丙肝病毒與乙肝病毒在生物學上存在許多差異， 但丙肝與乙肝在臨床等方面也存在許多類同點。
病毒感染傳播方式相似：HCV與HBV兩者均主要經過血液或輸血製品方式傳播。
臨床表現相似：但丙肝無症狀及無黃疸病例較乙肝多見， 丙肝有些患者不易被發現， 丙肝病毒抗體（抗-HCV)未列入體檢常規項目， 而乙肝表面抗原原已列入體檢常規項目， 但2009年12月29日衛生部宣佈取消入學、就業體檢中“乙肝五項”檢查。 因此， 丙肝患者常在肝功能檢查異常， 持續不降或反復波動， 且HBsAg又是陰性時， 才查丙肝抗體或HCV-RNA陽性時才發現。
丙肝與乙肝均有向肝炎慢性化及肝硬化發展的傾向：其發生率HCV比HBV更高， 丙肝發展為原發性肝細胞癌的危險性更大。
由於HCV與HBV傳播途徑相似， 所以丙肝與乙肝可以重疊感染， 且重疊感染較單個感染發生重症肝病率和病死率要高， 表明HCV與HBV重疊感染可加劇肝臟的損害。
HCV也可能有性傳播及母嬰垂直傳播：但不如乙肝發生率高。
