與其他類型肝炎相比， 自身免疫性肝炎的預後較好， 經過治療有80%-90%的患者能存活10年， 治療的成功有賴於恰當地選擇適應證、選擇適當的治療方案、療程足夠、及時處理併發症、定期檢查。
1、恰當地選擇適應證：針對不同治療方法選擇恰當的適應證是保證治療效果、避免嚴重併發症的重要措施， 應根據患者的病情及自身體質篩選合適的適應證。
2、選擇合適治療方案：選擇合適的治療方案是保證療效的前提， 不恰當的治療方法嚴重影響病情恢復， 治療時需結合患者具體情況實施個體化治療， 選擇合適的治療方案。
3、療程足夠：自身免疫性肝炎治療是個長期過程， 應保證足夠的療程， 不能堅持規範的治療不僅達不到治療效果， 還可能引發病情反彈、惡化。
4、及時處理併發症：治療期間如出現併發症， 應及時採取有效措施阻止病情發展。
5、定期檢查：不管是在治療期間還是停藥後， 患者都應定期進行肝功能、B超等檢查， 觀察肝臟的大小、有無脾臟的增厚， 有無門靜脈、脾靜脈的增厚， 以便醫生及時發現病情的變化調整治療方案。
