再障的預後因骨髓衰竭的程度、患者的年齡、治療是否及時以及所採用的治療方法等因素而各不相同。
急性型再障, 起病急驟, 病情發展迅速, 骨髓中造血細胞嚴重缺乏及伴有嚴重感染或出血, 尤其是顱內出血。 除非骨髓移植成功, 一般療效較差, 病死率高, 占91.6%。 多在起病後一年內死亡, 嚴重者可在數月甚至數周內死亡。 因貧血、感染及出血致死者, 慢性再障占24 .6%。
慢性型再障, 由於採用適當的治療, 病人的骨髓增生過低和全血細胞減少較輕, 病情穩定, 不再發展也不再進步, 這類病人可生存多年, 甚至20年以上。
兒童患者預後較好, 用藥物治療的療效比成人要好。 早治療比晚治療的療效要好。 支持療法可改善病人的體質, 防止出血和感染, 對延長生命以待骨髓功能逐漸恢復具有重要的意義。 致死的主要原因是嚴重感染和顱內出血。
治療得當, 極少數病人可完全恢復;尚有部分病人經過幾月或幾年, 血和骨髓象有較明顯進步, 但不能完全恢復正常。