1、手術時沒有準確地找到內口, 或處理內口不正確, 造成了假內口;或即使準確找到內口, 但未徹底清除感染的肛竇, 肛腺及內括約肌的原發病灶, 也可導致癒合不佳。
2、竇道尚未形成時急於手術, 使炎症擴散, 形成新的竇道和膿腔而影響癒合。
3、因瘺管彎曲, 術中造成假瘺道或瘺管被殘留, 或瘺道內的壞死組織搔刮不乾淨, 造成創傷口難以癒合和復發。
4、傷口縫合時留有間隙或死腔, 或縫合張力過大。
5、創口內留有異物, 如線頭, 棉絮等, 被周圍肉芽組織包埋, 影響創口正常生長癒合。
6、病人體質過分虛弱或伴有糖尿病,
為了預防上述情況的發生, 術中要徹底清除病灶, 以及消除不利於創面癒合的種種因素, 術後預防傷口感染, 可連續使用抗生素一周, 同時要保持創口引流通暢, 另外還要注意全身情況, 積極治療基礎疾病, 方能使肛瘺順利癒合。