甲真菌病的診斷主要依賴於甲屑的直接鏡檢和培養。
真菌學檢查
收集足夠的標本是關鍵, 遠端甲下型可用刮匙、牙科刮鏟及甲起子取甲下碎屑;近端甲下型可用甲鑽或解剖刀, 白色淺表型可用刮匙, 刮取病變區和正常區交界部位靠近甲床的甲屑, 加10%氫氧化鉀(KOH)直接鏡檢。 見到分支菌絲即可支援診斷。 需要注意的是, 青黴、麯黴、頭孢、鐮孢, 殼蠕孢和白念珠菌等可形成菌絲與假菌絲而與皮膚癬混淆。 沙堡瓊脂培養應採用兩管法(其一不含放線菌酮), 培養6~8周。
組織病理學
病甲角質增厚, 疏檢, 角質細胞呈網籃狀排列,