具有典型症狀的膽囊結石診斷比較容易， 但由於有些膽囊結石的病人沒有什麼症狀或症狀比較輕微， 沒有明顯的膽石症特點， 以致在診斷方面會走一些彎路， 沒有能及早發現。 例如有不少膽囊結石的病人， 在沒有查出膽囊結石之前， 常常因為上腹部不適、胃飽脹、噯氣及食欲不好等而被當作是胃炎、胃潰瘍或消化不良等， 吃了很長一段時間治胃病的藥， 但沒有什麼效果， 最後找到有經驗的醫生診治， 經B超檢查或口服膽囊造影而確診為膽囊結石。 診斷一明確， 治療能有的放矢， 自然效果也就好了。
與膽囊結石表現很相似的疾病主要有以下幾類：
(1)肝臟疾病：如病毒性肝炎、肝硬變等。
(2)胃腸道疾病：如胃腸道功能紊亂、消化性潰瘍、位置高的闌尾炎及右側結腸疾病等。
(3)膽道疾病：如膽道功能失調、膽囊腫瘤、膽囊息肉樣病變及膽道寄生蟲等。
(4)其他：如右側腎盂腎炎， 帶狀皰疹及神經根炎等。
由於上述疾病容易與膽囊結石混淆不清， 所以要求病人在就診時應系統地、仔細地講述自己疾病的發生及發展情況， 以便給醫生的診斷提供充足的資料。 同樣， 作為醫生也應全面地詢問病史， 詳細地進行各種有關的檢查， 並把獲得的資料進行綜合分析， 盡可能及時確診。
