對人體來說, 愛滋病病毒侵犯的是細胞免疫系統的TH淋巴細胞, 造成免疫能力缺陷, 最終的病人大都以出現臨床症狀的晚期感染表現;對病毒本身特異的抗原和抗體來說, 兩者的消長可說明疾病的所處狀態, 同時指導臨床分期的診斷。
一旦查出抗原陽性, 表示已感染愛滋病病毒, 這包含兩層意義或往往代表兩個感染的不同階段:如果愛滋病病毒攜帶者感染的病毒量大, 那麼, 病毒在TH淋巴細胞中的繁殖量亦較大, 雖然此時處於病毒感染的潛伏期, 但血清中可查愛滋病病毒的抗原, 對首次發現的愛滋病病毒的攜帶者來說,
愛滋病的抗體產生時間, 往往是感染愛滋病毒後4-12周才開始, 已不是感染的早期和“視窗”期(指病毒抗原消失, 但抗體尚未出現的一段空白時期), 而是潛伏期的指征。