目前， 科學家還無法準確地解釋為什麼試管嬰兒出生後會面臨更大的健康風險。 一些輔助生育學（IVF）專家指出， 與試管受精相關聯的疾病問題的高發率可以追溯到創造孩子胚胎時所用的卵子的缺陷。
三份新的研究顯示， 在做試管受精而備的卵子中平均有42%攜帶基因變異， 這會讓創造出來的胎兒難以順產。 一些專家暗示這歸咎於用來刺激排卵的藥物。 為了更方便地獲取卵子， 醫生都要給做試管受精手術的婦女事先服用排卵藥物。
據英國廣播公司報導， 實驗室裡用來創造胚胎的卵子經常會帶有基因缺陷，
這個發現， 預言性地推動了人們對使用胚胎植入子宮前基因診斷（PGD）的需求增加， PGD是一個檢查早期胚胎的一個單細胞的不正常基因的程式。 這個程式有時候可能直接就引起胚胎的死亡， 但更重要的是， 作為一種“搜索-消滅”的方法， 它有效地減少了被認為基因不良的孩子的數量。
現在， 首批試管嬰兒都已長大成人。 他們下一代的陸續出生， 讓試管嬰兒引發的健康問題變得更加複雜。
