強直性脊柱炎是否是遺傳病尚無定論， 但是90%強直性脊柱炎患者是有遺傳因素的。 所以強直性脊柱炎是一種與遺傳有密切關係的疾病， 況且經過大量的研究觀察發現， AS的病因目前尚未完全闡明， 大多認為與遺傳、感染、免疫環境因素等有關。
遺傳
遺傳因素在AS的發病中具有重要作用。 據流行病學調查， AS病人HLA-B27陽性率高達90%- 96%， 而普通人群HLA-B27陽性率僅4%～9%;HLA-B27陽性者AS發病率為10%～20%， 而普通人群發病為1‰～2‰， 相差約100倍。 有報導， AS一組親屬患AS的危險性比一般人高出20～40倍， 國內調查AS一級親屬患病率為24.2%， 比正常人群高出120倍。 HLA-B27陰性健康者，
但是應當看到， 一方面HLA-B27陽性者並不全部都發生脊柱關節病， 另一方面有5%～20%脊柱關節病病人檢測HLA-B27呈陰性， 提示除遺傳因素外， 壞右耳砷閃書影響AS的發病， 因此HLA-B2'7在AS表達中是一個重要出遺傳因素， 但並不是影響本病的唯一因素。
感染
近年來研究提示AS發病率可能與感染相關。 Ebrimger等發現AS病人大便中肺炎克雷白菌檢出率為79%， 而對照組
自身免疫
有人發現60%的AS病人血清補體增高， 大部分病例有IgA型類風濕因數， 血清C4和lgA水準顯著增高， 血清中有迴圈免疫複合物， 但抗原性質未確定。 以上現象提示免疫機制參與本病的發病。
